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作者:魏梦佳
北京大学与清华大学联合课题组近期在国际权威学术期刊《美国科学院院刊》发表论文,称开发出了名为“SHERRY”的转录组测序快速建库新方法。研究团队表示,这种方法大大简化了建库过程,不仅可用于高质量的单细胞转录组测序,对包括新型冠状病毒等样本的测序质量和速度也有望显著提升。
核糖核酸(RNA)是存在于生物细胞以及部分病毒、类病毒中的遗传信息载体。目前,RNA测序技术已广泛应用于绘制物种转录组图谱、研究疾病分子调控机制等方向。据了解,针对不同研究需求,不同起始量的RNA需采用不同的RNA扩增方法,但目前常见的扩增方法大多操作繁复、耗时长。对于微量样本的检测,也存在很多技术挑战。
研究人员发现,被广泛应用于DNA测序建库技术的Tn5转座酶可以直接作用于RNA/DNA杂交链,从而省去传统RNA建库技术中的扩增等必不可少但繁琐的操作步骤,同时也避免了预扩增过程中所带来的偏向性。
课题组专家、北京大学生物医学前沿创新中心主任谢晓亮教授表示,新方法应用广泛,首个临床应用是对新型冠状病毒感染者的样本进行测序。与现有的RNA测序建库方法相比,“SHERRY”更灵敏、更简单,这对检测和分析十分重要。